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抗擊新型冠狀病毒,安捷倫核酸/蛋白質質量控制產品從這些方面入手!

涉及 2019 復合型冠狀疫情(2019-nCoV),調查職工尚未精心謀劃地調查疫情發病基本原理、肺炎肺炎疫苗及中藥治療口服藥物等。在這些時候中,靶標樣版的安全性能正如繼往地取決于了調查的后面成與敗及耐用性。不管怎樣是肺炎肺炎疫苗設計規劃,抑可能核酸與細胞層次的發病基本原理調查,都離開對血清質與核酸樣版的安全性能有效控制。

自動化電泳產品線控制靶標樣本質量

采取新冠病毒性肺炎的調查分秒必爭,運用定時化的的品質把握品臺把握靶標樣板的品質可大大大節省了抓取畢竟的用時,此外保證畢竟的確切性與顯現性。

安捷倫自動化電泳產品線可以快速對 DNA、RNA、蛋白質樣本進行分析,獲得包括濃度與分子量在內的數字化信息,并直觀顯示樣本在電場下遷移形態的數字化圖像信息,同時針對二代測序技術(NGS)等對核酸完整性程度依賴性高的應用,還提供以 0-10 的數值來直觀反映樣本完整性的參數,以實現對樣本質量的快速且全面的評估(參見 RIN 值 與 DIN 值 )。

一、助力測序文庫的質量控制,縮短病毒基因測序時間

在報好名的“戰疫”中,對于代與測序系統水平(NGS)的宏基因遺傳組測序大拉長讀取疫情回文序列的日期,為核酸查重化學試劑盒的開發設計與住院病人.診得到了珍貴的日期。疫情突變的監測方案工做仍將堅持、大人數地實用代與測序系統水平,或是其中包括納米孔測序系統水平和第三代測序系統水平。不論什么用何用系統水平,對測序文庫的上機前效果把控好是要確保最終能夠后果不靠譜、間題可溯源的必切勿少的的環節。

目前疫情仍舊不容樂觀,研究人員面臨著樣本量激增、測序壓力大、質控樣本多的情況,針對這些問題,安捷倫 4200 TapeStation 中-高通量和 Fragment Analyzer 5300/5400 高-超高通量自動化核酸質控平臺可以為新冠病毒文庫的質量控制提供有力的保障。

圖 1. 利用 4200 TapeStation 系統對來源于腫瘤FFPE樣本的最終上機前的二代測序文庫進行質量控制,所得到的結果確認了全部 80 個樣品和 6 個陽性對照樣品的 DNA 文庫均已成功制備。質控數據包括樣本的濃度及分布、分子量及分布。

二、縮短蛋白質檢測與質控時間,加快抗體研發

在抗體的研發過程中,對抗體蛋白的檢測與質量控制必不可少。針對蛋白質分析,傳統的 SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE) 制膠過程繁瑣、電泳時間長。安捷倫 2100 生物分析儀可以替代 SDS-PAGE 的工作,通過蛋白質分子量大小的變化查看蛋白質的糖基化,對抗原抗體等進行質量控制,并提供從考馬斯亮藍級到銀染色級蛋白質含量和純度的檢測靈敏度。

圖 2. 在還原劑二硫蘇糖醇 (DTT) 存在的條件下,使用 2100 生物分析儀系統配合 Protein 80 (P80)、Protein 230 (P230) 和高靈敏度 Protein 250 (HSP-250) 試劑盒對人骨髓瘤 IgG2 進行分析。所示為每種分析的代表性電泳圖。在還原條件下,所采用的全部三種蛋白質分析均能夠清晰分離 IgG2 的輕鏈 (LC)和重鏈 (HC)。P230 和 HSP-250 分析中均可觀察到高分子量聚合物,而 P80 分析則分辨出與 IgG2 樣品相關的低分子量(摩爾質量)雜質。

三、控制轉錄產物 RNA 的質量,確保下游分析的成功

在木馬病毒可致研究數據分享進展、機器天然免疫回應和手機信號環路操縱的研究數據分享中,轉錄終產物 RNA 的重量操縱對下面數據分享的成與敗至關關鍵。安捷倫最初在 2100 生物工程數據分享儀上創立了 RNA 全版篇性運作 RIN 值(RNA Integrity Number),經在全球排名 20 年的APP, RIN 值終成為業界當今的 RNA 全版篇性運作。 安捷倫最新頭條新一批 TapeStation 核酸定性智能分析軟件,實際上還可以可以提供 RNA 詳細性數據,更充分滿足了樣表個數發生變化大的實踐室對通量靈可溶性性的意愿,可在1個樣表檢則人工成本不改變的癥狀下,體現 1-96 個任何個數樣表的檢則。

圖 3. 4 組總 RNA 濃度相同(300 ng/μL)但質量(降解程度)不同的大鼠總RNA樣本使用安捷倫 4200 TapeStation 系統分析。分析所得的 RIN 完整性當量RINe如膠圖中所示。可以看到,RNA 的完整性隨著 RINe 數值的降低在膠圖與峰圖中都呈現明顯的遞降。

安捷倫重新化電泳商品線能能滿足需要各不相同企業客戶的通量與技術采用要,技術采用款式涵蓋:

分子光譜產品用于疫苗生產的質控環節

在疫苗研發及之后的生產過程中,安捷倫分子光譜產品可以幫助研究機構和生產企業做好核酸和蛋白質定量,保證生產率和準確性。其中,安捷倫 Cary 60 UV-VisCary 630 FTIR 憑借其可靠性,已部署在全球眾多制藥 QA/QC 實驗室中,并具有可選軟件來滿足中國數據完整性法規要求。

紅外光譜可見分光光度計是目前分子結構菌物調查室的基本實驗儀器,具體用在法測核酸的飽和度、純度以其血清質的純度,為的檢測制劑盒的科研開發和制作供應的質量確認。

一、純度檢測

核酸的主要消除峰在 260 nm,核蛋白的主要消除峰在 280 nm 處。純的 RNA 打樣定制,260 nm 與 280 nm 吸光度測值(A260/A280)為 2.0;純的 DNA 打樣定制,A260/A280 為 1.8,那么,A260/A280 都可以作 DNA、RNA 含量查測的重要的指數。 核酸和淀粉酶質在 320 nm 都不會吸附,在測試圖片中,能能暫時性的將 320 nm 的吸光度用來歷史背景去掉。

二、濃度檢測

針對條件印刷品講,當 260 nm 處的吸光度值(A260)為 1 時,dsDNA 氨水濃度約為 50μg/mL, ssDNA 氧溶液濃硫酸有機廢氣濃度約為 37 μg/mL,RNA 氧溶液濃硫酸有機廢氣濃度約為 40 μg/mL,寡核苷酸氧溶液濃硫酸有機廢氣濃度約為 30 μg/mL(底物各不相同有相互影響)。因此,檢測提練后原材料在 260 nm 處的吸光度值,就能夠運算出 RNA/DNA 的氧溶液濃硫酸有機廢氣濃度。 紅外光譜常見分光光度計能夠短時間獲取圖紙在 190-1100 nm 時間范圍內每種光波波長下的吸光度值,為免疫試劑盒中 RNA 溶解度和核酸溶液濃度驗測出示短時間解決辦法工作方案。

圖 4. 安捷倫紫外可見分光光度計 5 次掃描 400 μL DNA 樣品光譜圖

表 1. 安捷倫紫外可見分光光度計 5 次測試 400 μL DNA 樣品純度和濃度

圖 5. Agilent Cary 3500 UV-Vis(左)和 Agilent Cary 630 FTIR(右)

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